Член КПСС до 1991 года 

Дальнейшая карьера

1993—1996 — начальник отдела внешних связей в Акционерном обществе закрытого типа «Русско-Германская лизинговая компания», дочерней структуре государственного Сбербанка России.
1996—1999 — работал в Управлении делами Президента РФ — заместителем генерального директора унитарного государственного предприятия по управлению собственностью за рубежом (УГП «Госзагрансобственность»).
1999—2000 — будучи офицером действующего резерва ФСБ, назначен руководителем службы безопасности «Транснефти»[6]; затем — вице-президент компании, курировал внешнеэкономический блок, зарубежные проекты и информационно-аналитическую работу.
С сентября 2000 по октябрь 2007 года — генеральный директор государственного предприятия «Российское внешнеэкономическое объединение „Зарубежнефть“» (ГП «РВО „Зарубежнефть“», с 2004 года — ОАО «Зарубежнефть»). На этом посту он сменил Олега Попова, который стал его заместителем. Работу в «Зарубежнефти» Токарев начал с кадровых и структурных изменений, а также с проведения аудита.
С 13 октября 2007 года — президент российской нефтепроводной госмонополии «Транснефть». На этом посту Токарев сменил Семёна Вайнштока.
Деятельность на посту президента «Транснефти»
В мае 2009 года «Транснефть» впервые раскрыла своих получателей благотворительной помощи. Среди них такие как фонд по содействию сотрудникам и ветеранам Федеральной службы охраны «Кремль-9». Пик благотворительных выплат (более 5 млрд руб.) пришелся на III квартал 2007 г. Это именно то время, когда Николай Токарев сменил Семена Вайнштока в руководстве «Транснефтью».

В 2016 года «Независимая Газета» опубликовала информацию о том, что в возглавляемой Токаревым «Транснефти» существует многомиллиардная теневая схема, выгодная руководству компании, в результате которой частные фирмы-однодневки обогащаются за счет государственной нефтяной компании. По этой схеме одни и те же компании-посредники фактически участвуют в тендере как в качестве заказчика, так и в качестве исполнителя, что позволяет им самим определять размер своего вознаграждения[8]. Стоимость тендеров по этой схеме только в марте 2016 года составила более 200 млн руб. Ключевыми элементами схемы является связанные между собой компании «Транснефть-Терминал» и ООО «ТНТ», находящиеся под контролем «Транснефти».

В годы правления Токарева Счетная палата выявила в компании нарушения на миллиарды рублей.

Близкий бизнес
Распределение бюджета «Транснефти» осуществляется в пользу структур бизнесмена Зиявудина Магомедова, у которых закупаются трубы и другие элементы трубопроводов. В 2011 г. корпорация на 80% дороже рыночной цены приобрела у Магомедова и его партнеров часть акций Новороссийского морского торгового порта (НМТП), по данным деловых изданий, в общей сложности переплатив $2,5 млрд. При этом компании Магомедова совместно с «Траснефтью» продолжают контролировать «НМТП», а также балтийские терминалы в Приморске. Средства, выведенные из «Транснефти» в рамках проектов «ВСТО», «КТК» И «БТС» Зиявудин Магомедов инвестирует в свои заграничные активы, — в частности, строительство порта в голландском Роттердаме.

Награды, почётные звания
Орден «За заслуги перед Отечеством» II степени (2013)
Орден «За заслуги перед Отечеством» III степени (2010)
Орден «За заслуги перед Отечеством» IV степени (2006)
Орден Почёта (2001)
Орден Дружбы народов
«Почётный нефтяник России»
«Почётный работник топливно-энергетического комплекса»
Критика
Николай Токарев критиковался в СМИ за то, что его ближайшие родственники владеют элитной зарубежной недвижимостью, которая не была задекларирована. Дочь и зять Токарева являются владельцами компаний («Катина» и «Т.Г.А.»), под контролем которых находится элитный курортный комплекс в Хорватии. Компания «Т.Г.А.» была учреждена женой Токарева. Компания «Т.Г.А.» управляется зятем Токарева через оффшорную фирму. При этом еще одна компания, владеющая тем же комплексом («Ядранка»), связана с «Транснефтью», президентом которой является Токарев. Российские законы запрещают госчиновникам всех уровней иметь собственный бизнес и владеть иностранной недвижимостью.

Скандальную известность в СМИ также получил тот факт, что Андрей Болотов стремительно разбогател после того, как женился на дочери Токарева. После свадьбы он получил многомиллионные активы, состоящие из десятков компаний. С 2000 года он сменил несколько компаний, в которых занимал высокие посты. В настоящее время Болотов занимает руководящий пост в Банке ВТБ; «Транснефть» является клиентом этого банка.

Интересные факты
В конце 2002 Токарев вместе с другими руководителями «Зарубежнефти» инициировал возбуждение Следственным комитетом МВД дела о мошенничестве в крупных размерах в связи с продажей прежним руководством предприятия принадлежавшего ей 10-процентного пакета акций «Севернефти», а также прочих махинаций, в результате которых «Зарубежнефть» потеряла около 100 млн долларов (для сравнения — общий доход компании в 2001 году составил 500 млн долл.)
2004 — согласно отчету ООН следственной комиссии Пола Волкера, расследовавшей махинации вокруг программы ООН «Нефть в обмен на продовольствие», с режимом Саддама Хусейна сотрудничали две фирмы с названием «Gunvor». Торговля с Ираком шла через «Зарубежнефть», которую возглавлял хороший знакомый главы Gunvor’а Тимченко, в последующем глава «Транснефти», Николай Токарев. По данным отчета Пола Волкера, Gunvor в общей сложности оказался причастен к продаже нефти на сумму порядка 500 млн долларов. Руководство «Зарубежнефти» утверждало, что все поставки были законными.
С 2006 по 2015 гг., согласно интервью Г.Стерлигова, финансировал издание факсимильных томов «Лицевого Летописного Свода» XVI в., которые последний раздавал у себя в Слободе на протяжении семи лет бесплатно всем желающим.

Семья
Жена: Галина. Владеет большим поместьем в деревне Акулинино, где кроме неё расположены усадьбы Якунина, Чемезова, Ротенберга и других приближенных Владимиру Путину чиновников и бизнесменов.
Дочь: Майя Николаевна Болотова — владелица фармацевтического холдинга «ФармЭКО» и «Ирвин 2». Кроме этого владеет компанией, управляющей элитным курортом в Хорватии и (вместе с мужем) компанией «РПА эстейт», на которую в 2016 году был куплен памятник архитектуры — Доходный дом Кекушевой на Остоженке.
Зять: Андрей Болотов — управляющий директор первого управления с крупными клиентами Банка ВТБ (сын отставного полковника ФСО Юрия Болотова)