Окончил Высшую Краснознаменную школу Комитета государственной безопасности СССР (1980 г.), имеет юридическое образование («юрист-правовед»).

В органах государственной безопасности с 1971 года, из них пятнадцать лет (с 1978 г.) – в легендарном спецподразделении «Альфа» Седьмого управления КГБ СССР.

Участвовал во многих операциях по освобождению заложников (в том числе в Сарапуле, Уфе, Минеральных Водах) и нейтрализации террористов. Возглавляя группу сотрудников «Альфы», прошел боевую стажировку на территории Демократической Республики Афганистан (был ранен). Завершил службу в должности заместителя командира Группы «А». Полковник в отставке.

В октябре 1992 года был избран президентом Ассоциации ветеранов подразделения антитеррора «Альфа», которая явилась первой организацией такого рода на территории Содружества Независимых Государств.

Под руководством С. Гончарова Ассоциация «Альфа» получила международный статус и стала крупнейшей и самой авторитетной организацией ветеранов силовых структур. Она насчитывает свыше 600 членов – ветеранов и действующих сотрудников Управления «А» Центра специального назначения ФСБ России, а также объединяет региональные Ассоциации ветеранов антитеррора – в Краснодаре, Екатеринбурге, Хабаровске и Республике Крым, имеет представительство в Республике Кыргызстан.

Автор газеты «Спецназ России» – старейшего военно-патриотического издания в России и СНГ (учреждена в 1994 г.). Автор книги «Россия в эпоху террора» (2003 г.).

Стоял у истоков «Системы «Альфы», в которую входят именные «альфовские» подшефные школы, военно-патриотические и военно-спортивные клубы в двадцати регионах России, коммерческие предприятия. Большая и всесторонняя помощь оказывается семьям погибших и умерших сотрудников Группы «Альфа» КГБ-ФСБ. Созданный ветеранами «Альфы» Мемориал Спецназа на Николо-Архангельском кладбище города Москвы стал местом, где с отданием всех воинских почестей хоронят погибших сотрудников Центра специального назначения ФСБ России.

С. Гончаров проделал большую работу по консолидации спецназовского ветеранского движения в бывших республиках Советского Союза, организуя разнообразные совместные мероприятия. А в августе 2013 года в Городе-Герое Волгограде с его непосредственным участием был проведен Международный Форум антитеррора, собравший элиту силовых структур.

В 1996 году был избран президентом Российского Союза предприятий безопасности (РСПБ) – при участии ветеранских организаций «Альфы», «Вымпела» и «Витязя».

Был депутатом Московской городской Думы пяти созывов – с 1996 по 2014 годы, являлся заместителем председателя комиссии по вопросам безопасности.

Награжден орденом Красной Звезды, медалью «За отвагу», медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени. Почетный сотрудник контрразведки. Кавалер Золотого Почетного знака «Общественное признание» (2003 г.). В 2007 году был награжден орденом Святого благоверного князя Димитрия Донского III степени.

Ассоциация ветеранов подразделения антитеррора «Альфа» — это адресная социальная поддержка ветеранов подразделения антитеррора «Альфа», членов их семей и семей погибших и умерших сотрудников.