С 2001 года — оперативники в главном управлении МВД России по Центральному федеральному округу. Затем Борис Колесников — начальник отдела 10-го оперативно-разыскного бюро (занимавшегося борьбой с организованной преступностью) департамента экономической безопасности МВД России

С августа 2011 года (после реорганизации МВД) — начальник управления «Б» (занимающегося расследованием преступлений в бюджетной сфере) нового ведомства — Главного управления экономической безопасности и противодействия коррупции МВД России (ГУЭБиПК).

С августа 2012 года — полковник и заместитель начальника ГУЭБиПК, курирует управления «Б» (преступления в бюджетной сфере), «К» (борьба с коррупцией) и «М» (расследование преступлений в сфере машиностроения и металлургии).

В октябре 2013 года получил специальное звание генерал-майора полиции.

Семья

Борис Колесников был женат, у него трое несовершеннолетних детей.

Служебная деятельность

Руководил и участвовал в следующих расследованиях и разоблачениях:

крупные махинации чиновников в Кабардино-Балкарии;
аферы с закупками томографов, изобличённые президентом Дмитрием Медведевым;
расследование в отношении главврача поликлиники № 2 управления делами президента Анатолия Бронтвейна, подозреваемого в получении «отката» за заключение госконтракта;
расследование в отношении и. о. руководителя подмосковного управления Росреестра Ольги Ждановой, подозреваемой в получение взятки за регистрацию недвижимости;
расследование в отношении одного из руководителей Южно-Российского госуниверситета экономики и сервиса, получившего взятку за назначение на должность;
расследование дела «Оборонсервиса»;
расследование в отношении заместителя директора Онкологического центра им. Герцена Сергея Безяева, подозреваемого в мошенничестве с госконтрактом;
расследование в отношении директора департамента Счётной палаты Александра Михайлика, подозреваемого в получении взятки за организацию внеплановой проверки ФГУП «Спорт-инжиниринг».

Дело в отношении сотрудников ФСБ

В конце 2013 года ведомство генерала Колесникова начало разработку в отношении неких Игоря Леонидовича и Валерия Александровича. Впоследствии в СМИ утверждалось, что Валерий Александрович — руководитель общественного фонда бывших сотрудников ФСБ, второе лицо — Игорь Леонидович Дёмин, замначальника 6-й службы 9-го управления ФСБ.

Один из посредников, задействованных в разработке сотрудников ФСБ, сдал оперативную информацию разрабатываемому ведомству, в результате чего ФСБ инициировало ответное расследование, арест подчинённых генерала, и в феврале вызов его самого в Следственный комитет в качестве свидетеля на допрос, перешедший в арест.

В марте 2014 года президент лишил генерала Колесникова должности[6]. В начале апреля 2014 Колесников направил письмо генпрокурору РФ Юрию Чайке и председателю СК РФ Александру Бастрыкину, изложив свою версию событий. В мае генерал стал одну за другой получать в СИЗО «бытовые» черепно-мозговые травмы. Подал жалобу в ЕСПЧ, утверждая, что его жизни угрожает опасность.

16 июня 2014 года во время допроса в Следственном комитете Колесников выпал с балкона 6 этажа и разбился насмерть. Согласно официальной версии, покончил жизнь самоубийством.

Версии гибели

Одними СМИ выставляется как высокопоставленный чиновник, пытавшийся сфабриковать дело о взятке, после ареста разбивший себе голову об стенку в СИЗО и выбросившийся с 6-го этажа СКР.

Другие СМИ и родственниками представляется как борец с коррупцией, которого арестовали после попытки разоблачения высокопоставленного взяточника-генерала ФСБ, затем несколько раз пробили ему в СИЗО голову и после допроса в СКР выбросили с 6-го этажа.

Существует версия, что ситуация возникла в связи с переделом «обнального рынка» терминалов наличной оплаты. Согласно этой версии, рынок курировался ГУЭБиПК, в том числе генералами Сугробовым и Колесниковым.