В конце 1998 года переехала в Москву.

В 1999 году устроилась в центральную поликлинику МЧС России в Москве, на должность врача-рефлексотерапевта.

В 2000—2007 годах — заместитель начальника по страховой медицине центральной поликлиники МЧС России в Москве.

Незадолго до парламентских выборов Лариса поменяла фамилию мужа — Фламенбаум, на свою девичью.

2 декабря 2007 года избрана депутатом Государственной думы Федерального Собрания Российской Федерации V созыва в составе федерального списка кандидатов, выдвинутого Всероссийской политической партией «Единая Россия». Являлась членом фракции «Единая Россия», членом комитета Государственной думы по охране здоровья.

4 декабря 2011 года избрана депутатом Государственной думы VI созыва в составе федерального списка «Единой России», является заместителем председателя думского комитета по Регламенту и организации работы Государственной Думы.

На парламентских выборах 2016 года заняла второе место в партийном списке Единой России по Красноярскому краю и республике Тува.

Факты

Л. К. Шойгу живёт в Москве, в районе метро Юго-Западная. Любит читать Брэдбери, Овчинникова, Чехова.

Семья
Отец — Кужугет Серээвич Шойгу (сентябрь 1921 — 1 декабря 2010), первый заместитель председателя Совета Министров Тувинской АССР.

Мать — Александра Яковлевна Шойгу (урожд. Кудрявцева; 1924—2011), ещё до войны семья переехала в город Стаханов Луганской области Украины. Во время войны осталась на оккупированной территории. В 1951 году, после окончания Харьковского зоотехнического института, попала по распределению в Туву. Работала главным зоотехником сельхозуправления Дзун-Хемчикского района, где и познакомилась с Кужугетом Шойгу, который был редактором районной газеты. В 1957 году семья переехала в Кызыл. В Туве жили в двухэтажном доме на улице Красных партизан. В 1970-х годах работала сначала экономистом, а затем начальником планового отдела Министерства сельского хозяйства республики. Неоднократно избиралась депутатом Тувинского областного Совета народных депутатов. В 1979 году вышла на пенсию.
Единокровная сестра — Светлана, работала телефонисткой в посёлке Туран. Трое детей.

Брат — Сергей Кужугетович Шойгу (род. 21 мая 1955), министр обороны Российской Федерации.

Невестка — Ирина Александровна Шойгу (урожд. Антипина; род. 1955), декан факультета «Высшая школа спортивной индустрии» РЭУ им. Г. В. Плеханова, президент компании «Экспо-ЭМ», вышла замуж за Сергея Шойгу в 1977 году, две дочери.

Племянницы:

Юлия Сергеевна Шойгу (род. 1977), кандидат психологических наук, на сентябрь 2008 года — директор Центра экстренной психологической помощи МЧС России (с 2002 года). Замужем за Алексеем Кузовковым, двое детей.

Ксения Сергеевна Шойгу (род. 1991), студентка экономического факультета МГИМО, снялась в эпизодической роли медсестры в фильме Никиты Михалкова «Утомлённые солнцем 2: Предстояние».

Младшая сестра — Ирина Кужугетовна Захарова (урожд. Шойгу; род. 1960), врач-психиатр, после окончания Томского медицинского института вышла замуж, жила в Саяногорске, Абакане. С середины 1990-х годов проживает в Москве. Замужем.

Муж — Константин Якубович Фламенбаум (род. 1948), хирург.

Сын — Александр Константинович Фламенбаум (род. 1975), юрист, гендиректор финансово-инвестиционной компании. Женат, сын и дочь.

Внук — Никита Александрович Фламенбаум (род. 1999), школьник.

Внучка — Мария Александровна Фламенбаум (род. 25 сентября 2008)